First report and genome sequencing of SARS-CoV-2 in a cat (Felis catus) in Colombia

BACKGROUND Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is a virus of zoonotic origin that can bind to ACE2 receptors on the cells of many wild and domestic mammals. Studies have shown that the virus can circulate among animals mutate, lead to animal-to-human zoonotic jump, and further onward spread between humans. Infection in pets is unusual, and there are few human-to-pet transmission reports worldwide. OBJECTIVE To describe the SARS-CoV-2 infection in a domestic animal in Córdoba, Colombian Caribbean region. METHODS A cross-sectional molecular surveillance study was carried out, oral and rectal swabs were taken from cats and dogs living with people diagnosed with coronavirus disease 2019 (COVID-19). RESULTS SARS-CoV-2 was found in a cat living with a person with COVID-19. Genome sequencing showed that the B.1.111 lineage caused the infection in the cat. The owner's sample could not be sequenced. The lineage is predominant in Colombia, and this variant is characterised by the presence of the D614D and Q57H mutation. CONCLUSION The present work is the first report of an infected cat with SARS-CoV-2 with whole-genome sequencing in Colombia. It highlights the importance of detecting SARS-CoV-2 mutations that could promote the transmissibility of this new coronavirus. There is still a significant information gap on human-to-cat-to-human infection; we encourage self-isolation measures between COVID-19 patients and companion animals. The findings of this study give a preliminary view of the current panorama of SARS-CoV-2 infection in animals in Colombia.

Consenso de grupo Ad-hoc sobre recomendaciones para la evaluación y controles de calidad para el diagnóstico molecular y serológico de la infección humana por SARS CoV-2 / Ad-hoc group consensus recommendations on the evaluation and quality control of molecular and serological diagnostics tests for SARS CoV-2 human infection

Se formulan recomendaciones de un grupo de consenso de expertos sobre los criterios para evaluar el desempeño diagnóstico (tamaño y selección de muestras para sensibilidad y especificidad analíticas, criterios para establecer límites de detección, criterios para establecer el estándar de oro para las serologías) que deberían ser tenidos en cuenta al evaluar y validar las pruebas diagnósticas para SARS CoV-2. Con el propósito de asegurar la calidad de las pruebas serológicas a utilizar en el país, se recomienda la participación en un programa de control de calidad externo, que garantice la idoneidad y desempeño en la realización de las pruebas diagnósticas serológicas y moleculares durante esta pandemia, ya que su uso tiene profundas implicaciones para las medidas de intervención clínicas individuales y de seguimiento y control en salud pública.

We formulate recommendations from a consensus working group on the criteria to evaluate the diagnostic performance (size and criteria of selection of samples to determine sensitivity, analytical specificity, criteria for limit of detection, criteria for gold standard to evaluate serological assays) that should be taken into account during the evaluation and validation/verification of diagnostic tests for SARS CoV-2 infection. A national external quality control program should be established to guarantee the suitability and performance of these diagnostic serological and molecular tests during this pandemic, that will have deep implications for decisions on clinical and public health.

Seroprevalence of arenavirus and hantavirus in indigenous populations from the Caribbean, Colombia

Abstract INTRODUCTION: In Colombia, there is insufficient epidemiological surveillance of zoonotic hemorrhagic viruses. METHODS: We performed a sero-epidemiological study in indigenous populations of Wayuü, Kankuamos, and Tuchin communities using Maciel hantavirus and Junin arenavirus antigens for IgG detection by ELISA. RESULTS IgG antibodies to hantavirus and arenavirus were found in 5/506 (1%) and 2/506 (0.4%) serum samples, respectively. CONCLUSIONS: Arenavirus and hantavirus circulate in indigenous populations from the Colombian Caribbean region, and the results indicate that the indigenous populations are exposed to these zoonotic agents, with unknown consequences on their health, despite low seroprevalence.

Coxiella burnetii infection in sheep and goats: a public risk health, Colombia / Infección por Coxiella burnetii en ovinos y caprinos: un riesgo en salud publica en Colombia

Objective. The aim of this study was to provide molecular evidence of C. burnetii in sheep and goats from some herds of Valledupar, Cesar, Colombia. Materials and methods. Fifteen herds of sheep and goats were chosen by convenience to investigate the infection by C. burnetii, during March and April of 2013. 328 female goats and 66 sheep from 15 herds were included in this study. Milk from ewes and vaginal mucus samples from goats were analyzed by Polymerase Chain Reaction for DNA detection of transposase gene (IS1111) of C. burnetii. Results. DNA of C. burnetii in 6% (4/66) of sheep's milk and 0.6% (2/328) vaginal mucus from goats was found. 13% (2/15) of the herds had at least one infected animal. Discussion. Our findings suggest the circulation of C. burnetii in sheep and goats from some herds of Valledupar, Colombia, and it highlights the possibility of occurrence of infections in humans and animals. Conclusions. The detection of C. burnetii in sheep milk could represent a public health risk factor for people who consuming raw milk, cheeses or people associated to agriculture and livestock handling. Further studies are necessary to evaluate other routes such as tick's bite, feces, milk from goats and vaginal mucus from sheep of this region of Colombia.

Objetivo. El objetivo de este estudio fue proporcionar evidencia molecular de infección por C. burnetii en ovinos y caprinos de algunos rebaños de Valledupar, Cesar, Colombia. Materiales y métodos. Quince rebaños de ovinos y caprinos fueron seleccionados a conveniencia para investigar la infección por C. burnetii, durante marzo y abril de 2013. En este estudio se incluyeron 328 caprinos y 66 ovinos de 15 rebaños. La leche procedente de ovinos y muestras de moco vaginal de caprinos fueron analizados mediante PCR (Reacción en Cadena de Polimerasa) para la detección de ADN del gen transposasa (IS1111) de C. burnetii. Resultados. Se encontró ADN de C. burnetii en 6% (4/66) de leche de oveja y 0,6% (2/328) de moco vaginal de cabras. El 13% (2/15) de los rebaños tenían al menos un animal infectado. Discusión. Nuestros hallazgos sugieren la circulación de C. burnetii en ovinos y caprinos de algunos rebaños de Valledupar, Colombia, y destaca la posibilidad de ocurrencia de infecciones en humanos y animales. Conclusiones. La detección de C. burnetii en la leche de oveja podría representar un factor de riesgo para la salud pública de las personas que consumen con frecuencia leche cruda, quesos o personas que trabajan en la agricultura y manipulación de ganado. Otros estudios son necesarios para evaluar otras rutas como la mordedura de la garrapata, las heces, la leche de las cabras y el moco vaginal de las ovejas de esta región de Colombia.

Primer caso del síndrome hemofagocítico asociado con posible infección con R ickettsia sp del grupo de las fiebres manchadas, Meta, Colombia / First case of haemophagocytic syndrome associated to probable infection with Rickettsia of spotted fever group, Meta, Colombia

El presente estudio describe un caso de síndrome hemofagocítico (SHF) probablemente asociado a la infección por una especie de Rickettsia del grupo de las fiebres manchadas (GFM). La paciente fue una niña de ocho años procedente de un área rural tropical del departamento del Meta, en el Oriente Colombiano, la cual fue admitida en el Hospital de Villavicencio con fiebre alta de tres días de evolución, dolor de cabeza, erupción, astenia, dolor abdominal, linfadenopatias y hepatoesplenomegalia. Los estudios serológicos para HIV, hepatitis, citomegalovirus, virus Epstein Barr entre otros resultaron negativos. La paciente fue admitida en un estudio de fiebres tropicales indiferenciadas, las muestras de suero pareadas fueron analizadas mediante inmunofluorescencia indirecta (IFI) para detección de anticuerpos IgG contra Rickettsia spp., del GFM y se encontró seroconversión de títulos de anticuerpos entre fase aguda (IgG 1:64) y convaleciente (IgG 1:1024). Dada la rápida remisión de las manifestaciones clínicas tras la instauración del tratamiento con doxiciclina, la causa del síndrome hemofagocítico fue atribuido a la infección por Rickettsia spp del GFM.

This study describes a case of hemophagocytic syndrome (SHF) probably associated with infection by a species of Rickettsia spotted fever group (SFG). The patient was an eight years old girl from a rural tropical area of Meta department, in eastern of Colombia, which was admitted to the Hospital of Villavicencio with high fever three days of evolution, headache, rash, asthenia, abdominal pain, lymphadenopathy and hepato-splenomegaly. Serological analyses for HIV, hepatitis, cytomega- lovirus, Epstein Barr virus, and other were negatives. The patient was admitted in undifferentiated tropical fevers and paired serum samples were analyzed through the indirect immunofluorescence assay (IFI) to detect antibodies IgG against Rickettsia of SFG. Antibodies titles in acute phase (IgG 1:64) and convalescent phase (IgG 1:1024) demonstrated seroconvertion. Because the rapid remission of clinical manifestations after treatment with doxiciclina, the cause of hematophagocitic syndrome was attributed to the infection by rickettsia of SFG.

Seroprevalencia de Brucella sp. en équidos de Córdoba, Colombia / Brucella sp. seroprevalence in equids of Córdoba, Colombia

La brucelosis es considerada una de las zoonosis más importantes en el mundo por sus implicaciones en la salud pública y sus repercusiones en la producción pecuaria. En la especie equina, la presentación de esta enfermedad es importante, debido a que estos animales son huéspedes potenciales y contribuyen con la introducción de la enfermedad en zonas no afectadas, así como el mantenimiento en donde ocurre de forma endémica. En el departamento de Córdoba no se registran estudios recientes que establezcan la prevalencia y características epidemiológicas de la enfermedad en équidos. El objetivo del presente estudio fue estimar la prevalencia de Brucella sp. en équidos del departamento de Córdoba. Se realizó un estudio descriptivo de corte transversal que incluyó 506 équidos procedentes de 14 municipios del departamento. Fueron estudiados tres especies: equinos (n=257), asnales (n=130) y mulares (n=119), procedentes de 46 predios. Las técnicas empleadas para el diagnóstico serológico fueron aglutinación rápida en placa Rosa de Bengala (n=506) y la confirmatoria fue con el ELISA competitiva (n=23). Se realizó la PCR convencional amplificando la región IS711de Brucella sp. a partir de muestras de exudado (n=2) y sangre con EDTA (n=4). La seroprevalencia de brucelosis en équidos fue del 4,5 % (23/506) por Rosa de Bengala (RB), con una distribución por especies de: equinos 20, asnos 2 y mulas 1. Con el ELISA competitiva (ELISA-C) la seroprevalencia fue del 4,3% (1/23), mientras que por PCR no se detectó ADN bacteriano en las seis muestras analizadas. La positividad en predios fue del 28,2% (13/46). Las cifras de seroprevalencia obtenidas en el presente estudio, demuestran la importancia de la vigilancia en las diferentes especies susceptibles a la brucelosis.

Brucellosis is considered one of the most important zoonotic diseases in the world because of its implications for public health and its impact on livestock production. In the equine species, the presentation of this disease is important, because these animals are potential hosts and contribute to the introduction of the disease in unaffected areas, as well as to the maintenance of this disease in endemic zones. In the Department of Córdoba, Colombia, there have been no recent studies that establish the prevalence and epidemiological characteristics of the disease in equids. The purpose of the present study was to estimate the prevalence of Brucella sp. in equids of the department of Córdoba. A cross-sectional descriptive study was carried out involving 506 equids from 14 municipalities of the department. Three species from 46 farms were studied: horses (n=257), asses (n=130) and mules (n=119). The techniques used for the serological diagnosis were: rapid agglutination, which was performed in 506 equids, using the Bengal Rose (RB) method; and the confirmatory method was performed on 23 equids, using the competitive ELISA tecnique (C-ELISA). Conventional PCR was performed by amplifying the IS711 region of Brucella sp. from exudate samples (n=2) and EDTA blood (n=4). The results of the study showed that the seroprevalence of brucellosis in equids was 4.5% (23/506) using the RB methodology, with the following distribution by species: 20 horses, 2 asses and 1 mule. With the C-ELISA technique, the seroprevalence was 4.3% (1/23), whereas by PCR no bacterial DNA was detected in the six samples analyzed. The positivity in farms was 28.2% (13/46). In conclusion, the seroprevalence figures obtained in the present study demonstrate the importance of epidemiological surveillance in the different species susceptible to brucellosis.

Epidemiological surveillance of herpes viral encephalitis in Cordoba, Colombia / Vigilancia epidemiológica de encefalitis por herpes virus en Córdoba, Colombia

Objective To establish an epidemiological surveillance of viral herpes encephalitis in major hospitals of Monteria, Cordoba. Methods From September 2009 to December 2011, a descriptive study of cases of viral encephalitis was made in three hospitals in the city of Monteria. Cerebrospinal fluid (CSF) samples from 118 patients were included in the study. Clinical aspects, as well as cytochemical and microbiological analysis (Gram stain and culture) of CSF, were used for selecting the patients. Virus detection was performed by using multiplex nested PCR for Herpes simplex virus 1 and 2, Epstein Barr virus, Cytomegalovirus and Varicella zoster virus. Results Viral DNA of herpesvirus was detected in the CSFs of 30 (25.4 %) participants, as follows: 22 (18.6 %) Herpes simplex 1 and 2 viruses, 4 (3.3 %) Cytomegalovirus and 1 (0.8 %) Varicella zoster virus. Co-infections were observed in 3 patients (2.5 %), 1 case by HSV-VZV and 2 cases by CMV/HSV. The clinical manifestations of the patients included: headache (18.6 %), fever (14.4 %), asthenia (10.1 %), seizures (9.3 %), vomiting (8.4 %), and stiff neck (5.9 %). Thirty percent of the patients also had HIV-AIDS. A case fatality rate of 20 % was observed for the patients. Conclusions This paper shows that herpesvirus is a cause of infection of the CNS in patients from Cordoba. This study contributes to the epidemiology of encephalitis, as well as to patient management.(AU)

Objetivo Establecer una vigilancia epidemiológica de la encefalitis viral herpética en los principales hospitales de Montería, Córdoba. Materiales y Métodos Se realizó un estudio descriptivo de los casos de encefalitis viral entre septiembre de 2009 diciembre de 2011 en tres hospitales en la ciudad de Montería. Las muestras líquido cefalorraquídeo (LCR) de 118 pacientes fueron incluidos en el estudio. Los aspectos clínicos como el análisis citoquímico y microbiológico (tinción de Gram y cultivo) de LCR fueron utilizados para la selección de los pacientes. La detección de virus se realizó por PCR anidada multiplex para Herpes simplex virus 1 y 2, virus de Epstein Barr, virus zoster de la varicela y el citomegalovirus. Resultados Se detectó ADN viral del virus del herpes en 30 (25,4 %) muestras de LCR en los pacientes de la siguiente manera: 22 (18,6 %) Herpes simplex virus 1 y 2, 4 (3,3 %) Citomegalovirus y 1 (0,8 %) del virus de la varicela zóster. Se observaron Co-infecciones en 3 pacientes (2,5 %), 1 caso por el VHS-VZV y 2 casos por CMV / HSV. Las manifestaciones clínicas de los pacientes fueron: cefalea (18,6 %), fiebre (14,4 %), astenia (10,1 %), convulsiones (9,3 %), vómitos (8,4 %), y rigidez de nuca (5,9 %). El treinta por ciento de los pacientes también tenía VIH-SIDA. Se observó una tasa de letalidad del 20 % de los pacientes. Conclusiones Se demuestra que el herpesvirus es causa de infección del SNC en pacientes en Córdoba. Este estudio contribuye a la caracterización serológica viral epidemiológica de la encefalitis viral, así como en el manejo del paciente ya que se describen hallazgos clínicos importante en la población adulta estudiada.(AU)

Diversidad de roedores, hantavirus y su relación con la salud pública / Diversity of rodents, hantavirus and its relationship to public health

El orden Rodentia comprende el grupo de mamíferos con la mayor diversidad de especies vivientes que son hospederos y reservorios naturales de hantavirus. Los hantavirus que causan síndrome cardiopulmonar en América utilizan como reservorio a la subfamilia Sigmodontinae. Cada hantavirus posee afinidad con un roedor hospedero específico. En 1976 en Corea se cultivó del pulmón del ratón Apodemus agrarius, el primer virus Hantaan. En 1978 se identificó el virus Seoul de Rattus norvegicus. En 1997 en Finlandia se aisló el hantavirus Puumala del pulmón de Myodes glareolus. En 1993 se aisló hantavirus Dobrava (Eslovenia) de Apodemus flavicolis y en 1982 fue aislado de Microtus pennsylvanicus el primer hantavirus no patógeno en las Américas: Prospect Hill. No obstante, en 1993 una misteriosa enfermedad pulmonar se expandió en Four Corners (USA); los pacientes repentinamente enfermaron y muchos murieron debido a shock y/o edema pulmonar; los síntomas no fueron asociados con hantavirus. Más tarde se aisló un nuevo hantavirus del roedor Peromyscus maniculatis, el cual era desconocido, y se lo denominó como Virus Sin Nombre y se asoció como la causa de este brote epidémico. En Suramérica se han reportado hantavirus en distintos hospederos naturales. En Colombia, entre 2004 y 2015 se han publicado diversos estudios realizados en el Caribe colombiano y en Urabá en los que se evidenció la presencia de hantavirus en humanos y en roedores. Recientemente se tuvo el primer reporte serológico de infección por hantavirus en humanos en la región de la Orinoquia colombiana. Sin embargo, la hantavirosis no es considerada una enfermedad de notificación obligatoria, y es probable que actualmente esté en silencio epidemiológico.

The order Rodentia comprises the group of mammals with the greatest diversity of living species that are natural hosts and reservoirs of hantavirus. Guests are natural reservoirs and hantavirus. All hantavirus that cause cardiopulmonary syndrome in the Americas are linked to the subfamily Sigmodontinae. Each hantavirus has affinity for a specific rodent host. In Korea the first Hantaan virus was isolated in 1976 from a lung culture of field mouse Apodemus agrarius. In 1978, the Seoul virus was identified from Rattus norvegicus. In Finland, the Puumala hantavirus from Myodes glareolus lung. In 1993, hantavirus Dobrava from Apodemus flavicolis was isolated in Slovenia and in 1982 the first hantavirus in the Americas called Prospect Hill isolated form Microtus pennsylvanicus, which resulted nonpathogenic and for this reason it was believed that the American hantavirus were nonpathogenic. However, in 1993 a mysterious lung disease began spreading in Four Corners (USA), the patients suddenly became ill and many died due to shock and/or lung edema; these early symptoms were not associated with hantavirus but a virus subsequently isolated from Peromyscus maniculatis was a new virus now known as hantavirus without name was cause of this outbreak. In South America hantavirus have been reported in different natural hosts. In Colombia between 2004 and 2006 the first serological studies in the Colombian Caribbean, where they reported the circulation of hantavirus in humans and rodents, were published. However, hantavirus is not considered a reportable disease and probably currently it is in epidemiological silence.

Seroprevalencia de anemia infecciosa equina en los departamentos de Córdoba y Bolívar, Colombia / Seroprevalence of Equine Infectious Anemia in the Departaments of Córdoba and Bolivar, Colombia

La anemia infecciosa equina (AIE) es una enfermedad causada por un virus ARN de la familia Retroviridae, subfamilia Lentiviridae que afecta a todos los miembros de la familia de los équidos y posee distribución mundial. El objetivo del presente estudio fue estimar la seroprevalencia del virus de la anemia infecciosa equina (VAIE) en los departamentos de Córdoba y Bolívar, Colombia. Se realizó un estudio prospectivo que incluyó 380 équidos escogidos de forma aleatoria procedente de seis municipios de Córdoba (Montería, Puerto Escondido, Los Córdoba, Canalete, Sahagún y San Antero) y cinco municipios de Bolívar (El Carmen de Bolívar, Mompox, María la Baja, Magangue y Turbaco). Tres especies fueron incluidas: equinos (n=305), asnal (n=46) y mular (n=29), pertenecientes a 42 predios en los dos departamentos. El presente estudio permitió establecer una seroprevalencia al VAIE de 9,7% (37/380) en el total de équidos analizados, siendo para el departamento de Córdoba de 7,73% (15/194) en cuanto a los animales y de 53,8% (7/13) en predios y para el departamento Bolívar fue de 11,8% (22/186) en los animales y en predios de 34,48% (10/29). El presente estudio permitió conocer la seroprevalencia del VAIE en los departamentos de Córdoba y Bolívar y algunos datos demográficos relacionados con la enfermedad en estas regiones del país.

The Equine Infectious Anemia (EIA) is a disease caused by an RNA virus of the family Retroviridae, subfamily Lentiviridae, that affects all members of the Equidae family with a worldwide distribution. The main goal of this study was to estimate the seroprevalence of the Equine Infectious Anemia Virus (EIAV) in the Departments of Bolívar and Córdoba, Colombia. A prospective study was carried out and included 380 equidae from six municipalities of Córdoba (Montería, Puerto Escondido, Los Córdobas, Canalete, Sahagún, and San Antero) and five municipalities of Bolívar (El Carmen de Bolívar, Mompox, María La Baja, Magangue, and Turbaco). The animals were randomly selected and three species were included, namely donkeys (n=46), mules (n=29), and horses (n=305) from 42 farms in the two departments studied. The results enabled to establish a EIAV seroprevalence of 9.7% (37/380) in the total number of equidae analyzed in the Departments of Córdoba and Bolívar. The seroprevalence distribution was as follows: for the Department of Córdoba, 7.73 % (15/194) in terms of animals and 53.8 % (7/13) for the farms. For the Department of Bolívar, 11.8 % (22/186) in animals and 34.48 % (10/29) for the farms. These results also allowed to know some demographic data related to this disease in these regions.

Seroprevalencia de Hantavirus, Rickettsia y Chikungunya en población indígena del municipio de Tuchín, Córdoba / Seroprevalence of Hantavirus, Rickettsia y Chikungunya in the indigenous populationof Tuchín, Córdoba

Introducción: La vigilancia de las enfermedades transmitidas por vectores es importante para establecer medidas de control en salud pública. Las poblaciones indígenas de Córdoba viven en condiciones geoclimáticas que favorecen la presencia de vectores que podrían permitir la diseminación y aparición de hantavirosis, rickettsiosis y fiebre por el virus Chikungunya. Objetivo: Establecer la seroprevalencia de Hantavirus, Rickettsia sp. y Chikungunya en la población indígena de Tuchín, Córdoba. Materiales y métodos: Se realizó un estudio descriptivo de corte transversal en 190 individuos del resguardo indígena del municipio de Tuchín; el muestreo fue realizado entre agosto y diciembre del 2012. La detección de anticuerpos IgG contra Hantavirus se llevó a cabo con la prueba IgG DxSelectTM (Focus Technologies, EL1600G, California, EE. UU.), anticuerpos IgG contra Rickettsia sp. se determinaron por inmunofluorescencia indirecta y se realizó detección de anticuerpos IgG contra el virus Chikungunya mediante ELISA de captura (Nova-Tec, inmunodiagnostica GmbH, CHIG0590, Alemania). Resultados: De 190 sueros analizados, el 5,2% (10/190) fueron positivos para Rickettsia sp. del grupo de la fiebre manchada, para Hantavirus 7 de 87 (8%) fueron positivos y no se encontraron positivos para Chikungunya. No se encontraron diferencias significativas (p = 0,05) entre los seropositivos de Hantavirus y Rickettsia sp. para las variables género, edad y ocupación. Conclusiones: Los hallazgos demuestran exposición previa a Rickettsia sp. y a Hantavirus en la población indígena de Tuchín. Los resultados pueden ser útiles para establecer una alerta sobre estas fiebres hemorrágicas. Aunque no se hallaron seropositivos para Chikungunya, este fue el primer trabajo de vigilancia epidemiológica realizado en Colombia sobre este virus.

Introduction: Vector-borne disease surveillance is important for establishing control measuresin public health. Indigenous populations of Cordoba live in climate conditions that favor the presence of vectors that might allow the spread and emergence of hantavirus cases, rickettsial and Chikungunya fever. Objective: To establish the prevalence of Hantavirus, Rickettsia sp. and Chikungunya in theindigenous population of Tuchín, Cordoba. Materials and methods: A cross-sectional descriptive study on 190 individuals of the indigenous reservation of the municipality of Tuchín was carried out; the serum samples were collected between August and December of 2012. The following serology tests were performed: antibody IgG against Hantavirus IgG Dx Select TM (Focus Technologies, EL1600G, California, USA); indirect immunofluorescence technique for Rickettsia spotted fever group IgG and ELISA IgG antibodies against Chikungunya virus (Nova-Tec, diagnostic GmbH, CHIG0590, Germany). Results: Out of 190 analyzed sera, 5.2% (10/190) were positive for Rickettsia sp. spotted fever group, Hantavirus 7 of 87 (8.0%) and 0% for Chikungunya. Significant differences among those positive for Hantavirus and Rickettsia sp. for the variables gender, age and occupation were not found. Conclusions: The findings reveal the prevalence of Rickettsia sp. and Hantavirus in the indigenous population of Tuchín. These results are useful to establishing an alert regarding thesehemorrhagic fevers. Although no positive result for Chikungunya virus was found, this is the first epidemiological surveillance study conducted in Colombia on this virus.

Coxiella burnetii in bulk tank milk and antibodies in farm workers at Montería, Colombia / Coxiella burnetii en leche de tanque y anticuerpos en trabajadores rurales en Montería, Colombia / Coxiella burnetii em leite de tanque bovina e anticorpos em trabalhadores rurais de Montería, Colômbia

Background: Q fever is a zoonotic disease caused by Coxiella burnetii. In Colombia it is not a notifiable disease in humans and is most likely under diagnosed. There are no studies about its prevalence in important reservoir species, such as cattle. Objective: the aim of this study was to investigate the frequency of C. burnetii infection in cattle farms and determine the frequency of antibodies in farm workers at risk in rural areas of Montería, Córdoba (Colombia). Methods: eleven cattle farms were randomly chosen to investigate the infection by C. burnetii. Bulk tank milk samples of each farm were analyzed by conventional PCR for DNA detection of transposase gene IS1111 of C. burnetii. Serum samples from 61 apparently healthy people living in eight farms were analyzed by indirect inmunofluorescence against phase II IgG antibodies to C. burnetii. Results: we report the presence of C. burnetii DNA in 45% of bulk tank milk samples from cattle farms and a 61% frequency of antibodies (IgG phase II ≥1/64) in farm workers at risk. Conclusion: our results demonstrate the circulation of this bacterium in the studied farms in Montería, Colombia, showing that at-risk farm workers have a high antibody frequency.

Antecedentes: la fiebre Q es una zoonosis causada por Coxiella burnetii. En Colombia no es una enfermedad notificable en humanos y probablemente es subdiagnosticada. De otro lado, no se han realizado estudios acerca de su prevalencia en importantes reservorios como los bovinos. Objetivos: el objetivo de este estudio fue determinar la frecuencia de infección por C. burnetii en fincas de ganado bovino y determinar la frecuencia de la presencia de anticuerpos en trabajadores de fincas en riesgo en áreas rurales del municipio de Montería, Córdoba (Colombia). Métodos: once fincas de ganado bovino fueron aleatoriamente seleccionadas para investigar la frecuencia de infección por C. burnetii. Muestras de leche de tanque de cada finca fueron analizadas mediante PCR convencional para detección del gen transposasa IS1111 de C. burnetii. Asimismo, se colectaron muestras de suero sanguíneo de 61 personas aparentemente saludables que vivían en ocho de las fincas estudiadas, las cuales fueron analizadas mediante el ensayo de inmunofluorescencia indirecta para detección de anticuerpos IgG contra fase II de C. burnetii. Resultados: en este estudio se reporta la presencia de ADN de C. burnetii en 45% de las muestras de leche de tanque de las fincas ganaderas estudiadas y una frecuencia de anticuerpos contra C. burnetii (IgG Fase II ≥1/64) del 61% en trabajadores de fincas en riesgo. Conclusiones: los resultados de este estudio demuestran la circulación de C. burnetii en las fincas estudiadas de un área de Montería, Colombia. También, los trabajadores de fincas en situación de riesgo presentan una alta frecuencia de anticuerpos contra este patógeno.

Antecedentes: a febre Q é uma zoonose causada por Coxiella burnetii. Na Colômbia não é uma doença de notificação obrigatória em seres humanos e é provavelmente subdiagnosticada. Além disto, não há estudos sobre sua prevalência nas principais espécies de reservatórios, como os bovinos. Objetivos: determinar a frequência de infecção por C. burnetii em fazendas de gado de leite e determinar a frequência de anticorpos em trabalhadores rurais em risco do município de Montería, Córdoba (Colômbia). Métodos: 11 fazendas de gado leiteiro foram selecionadas aleatoriamente para investigar a frequência de infecção por C. burnetii. Amostras de leite do tanque de cada fazenda foram analisadas por PCR convencional para a detecção do gene IS1111 transposase de C. burnetii. Além disso, amostras de soro de 61 pessoas aparentemente saudáveis que vivem em oito das propriedades estudadas foram analisadas por imunofluorescência indireta para a detecção de anticorpos IgG contra C. burnetii fase II. Resultados: neste estudo, o DNA de C. burnetii foi encontrado em 45% das amostras de leite do tanque, e uma frequência de anticorpos contra C. burnetii (fase II IgG ≥ 1/64) de 61% em trabalhadores rurais em risco. Conclusões: os resultados deste estudo demonstram a circulação de C. burnetii em algumas fazendas de gado em uma área de Montería, Colômbia. Além disso, os trabalhadores rurais em situação de risco têm uma alta frequência de anticorpos contra este patógeno.

Seroprevalencia de Rickettsia sp. en indígenas Wayuü de la Guajira y Kankuamos del Cesar, Colombia / Seroprevalence of Rickettsia sp. in indigenous Wayuü of La Guajira and Kankuamos of Cesar, Colombia

Objetivo: Determinar la seroprevalencia de Rickettsia sp. del grupo de las fiebres manchadas en indígenas Wayuu (La Guajira) y Kankuamos (Cesar), Colombia. Materiales y métodos: Entre agosto de 2012 y mayo de 2013 se realizó un estudio descriptivo, prospectivo, de corte transversal donde se recolectaron sueros de indígenas Wayuü (n = 171) y Kankuamos (n = 167). Los sueros fueron analizados por IFI para Rickettsia sp. Resultados: La población Wayuü presentó una seroprevalencia del 11% y la Kankuama, del 32%. La mayor seropositividad se obtuvo en mujeres Wayuü (89%), siendo del 65% en Kankuamas. En ambas poblaciones las amas de casa fueron seropositivas en un 34% (25/73). De los seropositivos de la población Wayuü, el 58% (11/19) estaban distribuidos en barrios periféricos de Maicao y el 42% (8/19) en pequeños conglomerados rurales cercanos (rancherías). Los seropositivos de la población Kankuama se distribuyeron de la siguiente forma: 52% (28/54) en Atánquez, 32% (17/54) en Valledupar, 9% (5/54) en La Mina y 7% (4/54) en Pontón. La presencia de garrapatas en los Wayuü fue reportada en el 42%, y en los Kankuamos, en el 96%. Conclusión: Este es el primer estudio de seroprevalencia de Rickettsia en poblaciones indígenas de los departamentos de La Guajira y el Cesar, que permitió demostrar la infección por Rickettsia sp., del grupo de las fiebres manchadas. Los resultados indican una alta seroprevalencia en la población Kankuama y moderada en la población Wayuü. Los datos pueden ser utilizados en los programas de vigilancia y control de síndromes febriles.

Objective: To determine the seroprevalence of Rickettsia sp. of Spotted Fever Group (SFG) in indigenous Wayuu (La Guajira) and Kankuamos (Cesar), Colombia. Materials and methods: Between August 2012 and May 2013 a descriptive, prospective, crosssectional study was carried out. Sera from Wayuu (n = 171) and Kankuamos (n = 167) indigenous populations were collected. To determine Rickettsia sp., the samples were analyzed by IFI. Results: The Wayuu population showed a seroprevalence of 11% and Kankuama 32%. Most seropositives were women, 89% and 65% in the Wayuu and Kankuama populations respectively. In both indigenous populations, a seropositivity of 34% (25/73) in housewives was obtained. The highest percentage, 58% (11/19) of seropositives in the Wayuu population were distributed in neighborhoods of Maicao and 42% (8/19) were in nearby small rural settlements. The Kankuama seropositive population was distributed as follows: 52% (28/54) in Atánquez, 32% (17/54) in Valledupar, 9% (5/54) in La Mina and 7% (4/54) in Pontoon. The presence of ticks in the Wayuu population was reported in 42% and Kankuamos in 96% Conclusion: This is the first study on seroprevalence of Rickettsia in indigenous populations of the departments of La Guajira and Cesar. The results indicate a high seroprevalence in the Kankuama population and a moderate seroprevalence in the Wayuu. These data can be important for surveillance and control programs of febrile syndromes.

Guías Latinoamericanas de la RIICER para el diagnóstico de las rickettsiosis transmitidas por garrapatas / Latinamerican guidelines of RIICER for diagnosis of tick-borne rickettsioses

Tick-borne rickettsioses are worldwide infectious diseases that are considered emerging and re-emerging. Until recently the only tick-borne rickettsiosis present in Latin America was Rickettsia rickettsii infection, but to date, with the incorporation of new tools as PCR and sequencing and the quick cellular close tube cultures (Shell-vial), new species has been involved as human pathogens. In these guidelines, we offer an update of the microbiological assays for diagnosing rickettsioses. Besides we have included a section in which the most important hard ticks involved in human rickettsioses in Latinoamerica are detailed.

Las rickettsiosis transmitidas por garrapatas son afecciones de distribución mundial, que por diferentes motivos se pueden considerar emergentes y reemergentes. Hasta hace escasos años la única rickettsiosis transmitida por garrapatas en Latinoamérica era la infección por Rickettsia rickettsii, pero en la actualidad y fundamentalmente, gracias a la incorporación de nuevas herramientas para el diagnóstico microbiológico como la reacción en cadena de la polimerasa y secuenciación o el cultivo celular rápido en tubo cerrado, se han descrito e involucrado otras especies de Rickettsia en la producción de patología humana. En estas guías se detallan y describen las diferentes técnicas utilizadas para el diagnóstico microbiológico de las rickettsiosis. Además, se incluye una sección en la que se detallan las especies más importantes de garrapatas duras relacionadas con las rickettsiosis en Latinoamérica, con claves para su clasificación taxonómica.